С вводом зимнего графика движения (с 30 октября 2011 года) расписание ряда поездов "Сапсан" будет изменено. Основное изменение коснется поездов "Сапсан" сообщением Санкт-Петербург – Нижний Новгород (через Москву). Данный маршрут будет отменен. Вместо этого маршрута будут назначены поезда "Сапсан" Санкт-Петербург – Москва и Москва – Нижний Новгород.
Выведение из расписания движения скоростных поездов маршрута Санкт-Петербург – Нижний Новгород (через Москву) связано, в первую очередь, с тем, что в скором времени на Курском вокзале Москвы будет введена система досмотра пассажиров, следующих поездами "Сапсан", по аналогии с терминалом на Ленинградском вокзале Москвы. Для этой цели будет построен досмотровый павильон на 11 посадочной платформе Курского вокзала. Для организации досмотра пассажиров при существующем графике движения необходим одновременный прием поездов "Сапсан" из Нижнего Новгорода и Санкт-Петербурга на 11 посадочную платформу, что технически невозможно осуществить. Изменение движения электропоездов "Сапсан" с целью последовательного приема на 11 посадочную платформу Курского вокзала Москвы потребовало бы корректировки расписания движения более 60 пригородных поездов. Такого ОАО "РЖД" допустить не может ввиду огромной социальной значимости пригородных перевозок.
Прямой пассажиропоток между Санкт-Петербургом и Нижним Новгородом на поездах "Сапсан" составляет порядка 8%. Эти пассажиры смогут совершать поездки поездами "Сапсан" из Санкт-Петербурга в Нижний Новгород с пересадкой в Москве. В настоящее время заканчивается разработка расписания движения поездов "Сапсан", которое позволит транзитным пассажирам делать пересадку в Москве и без спешки перемещаться с Курского вокзала на Ленинградский для продолжения поездки.
Зимнее расписание поездов "Сапсан" ОАО "РЖД" опубликует дополнительно.